Samodzielny Zakład Chorób Drobiu Wydziału Weterynaryjnego Wyższej Szkoły Rolniczej w Olsztynie powołano w 1972 r. Kierownikiem Zakładu była prof. dr hab. Irena Janowska. Do 1986 r. Zakład należał do Instytutu Chorób Zakaźnych i Inwazyjnych. W latach 1986 - 1991 organizacyjnie wchodził w skład Katedry Epizootiologii. W związku z poszerzeniem zakresu dydaktyki oraz działalności usługowej i badawczej o nowe gatunki ptaków (m.in. gołębie i ptaki ozdobne, ptaki wolnożyjące), w 1988 r. Zakład Chorób Drobiu przemianowano w Zakład Chorób Ptaków. Natomiast od stycznia 1992 r., jednostka funkcjonuje jako Katedra Chorób Ptaków – samodzielna jednostka organizacyjna. Po przejściu prof. dr hab. Ireny Janowskiej (1996 r.) na emeryturę, kierownikiem Katedry był prof. dr hab. Andrzej Koncicki, prof. zw. Od października 2024 roku funkcję tę pełni prof. dr hab. wet. Tomasz Stenzel. Działalność naukowa Katedry koncentruje się wokół dwóch głównych zagadnień – wirusologii molekularnej oraz immunologii. Pracownicy Katedry realizowali liczne granty naukowe oraz usługi badawcze (w tym pełne eksperymenty) i diagnostyczne dla podmiotów zewnętrznych. Działalność dydaktyczna związana jest z realizacją przedmiotów „Choroby Ptaków”, „Staż Kliniczny - Choroby Ptaków”, „Choroby Ptaków Ozdobnych”, „Technologie w produkcji zwierzęcej”. Zajęcia realizowane są w językach polskim oraz angielskim i cieszą się dużym uznaniem wśród studentów.